История второй части "Гандам: Сконструированные Бойцы" начинается спустя 7 лет после того, как Иори Сэй и Рэйджи выигрывают седьмой Чемпионат мира по сражениям Ганпла. В настоящее же время клуб, посвященный сражениям Ганпла Академии Сэйхо, насчитывает лишь одного члена, Хошино Фумину, ученицу третьего класса средней школы. Как президенту клуба ей необходимо найти хотя бы двух участников, чтобы принять участие в предстоящем Чемпионате Ганпла, проходящем по всей Японии. И однажды она встречает переведенного ученика по имени Камики Сэкай, который путешествует по Кэмпо, тренируясь вместе со своим учителем. После к ним присоединяется и молодой конструктор моделей Ганпла, Косака Юма.
С этого момента начинается их путь на Чемпионат...
Нильс Нильсен приглашает Сэя, Мэйдзина и других членов отряда на новый стадион для демонстрации боевой системы, которую он планирует показать завтра на официальной церемонии в честь завершения строительства. Но перед тестовым боем Нильс замечает, что в его системе не хватает одной важной детали. Тем временем группа неизвестных берёт под контроль все системы стадиона, чтобы вступить в битву с отрядом «Гандам».
Эта история ближайшего будущего, когда сражения Ганпла, соревнования, которые проходят между двумя пластиковыми моделями Гандамов, стали популярными во всём мире. Сэй Иори, который учится в первом классе средней школы и является единственным сыном владельца магазина, встречает таинственного мальчика по имени Рэйджи. Рэйджи по иронии судьбы оказывается опытным бойцом Гандамов. Рэйджи и Сэй вместе стремятся на чемпионат мира по сражениям пластиковых моделей Ганпла, чтобы выиграть его.