Проснувшись в странном виртуальном мире без единого воспоминания о своём прошлом, Хакуно Кисинами обнаруживает, что он оказался втянутым в битву на выживание. Приз за победу в этой войне бесценен — это исполнение любого желания. Вместе со «слугой», загадочной девушкой, которая встала на сторону главного героя, Хакуно вынужден сражаться на смерть с другими участниками Войны за Святой Грааль. Соглашаясь участвовать в битвах, Кисинами преследует особую цель — найти ответ на вопрос, кто же он такой.
Добравшись до Великого храма времени, члены тайной организации Chaldea готовятся к решающей битве с королём магов Соломоном, чтобы защитить человечество и уничтожить главный источник зла.